Predicting drug sensitivity and resistance; Profiling ABC transporter genes in cancer cellsCancer Cell. 2004 Aug;6(2):129-37癌種 specific に発現する薬剤排出トランスポータは何か? とか薬剤 specific に発現亢進するトランスポータは何かなどを調…

Alternative mapping of probes to genes for Affymetrix chipsBMC Bioinformatics. 2004 Aug 14;5(1):111NetAfx でついているアノテーションって言うか，probe ⇔ gene の対応関係ゲロゲロ，ウチでちゃんとしたの作ったよってお話．でも，イマイチどう作った…

Gefitinib-sensitizing EGFR mutations in lung cancer activate anti-apoptotic pathScience. 2004 Aug 20;305(5687):1163-7. Epub 2004 Jul 29.なんか，今朝は(この論文の話ではないけど)新聞・TV ネタになっていた Iressa(Gefitinib)のお話．要は Iressa …

Hit-to-lead studies: the discovery of potent, orally active, thiophenecarboxamide IKK-2 inhibitors.Bioorg Med Chem Lett. 2004 Jun 7;14(11):2817-22 読んで字のごとく HTS であたってきた化合物からリードまでどのように開発してきたかというケース…

A first-draft human protein-interaction mapGenome Biology 2004, 5:R63Yeast, C.elegans, Drosophila の protein-interaction map からオーソログを伝ってヒトの (putative) protein-interaction map を作りましたというお話．網羅性が高い(特に Yeast) …

Graph-based iterative Group Analysis enhances microarray interpretationBMC Bioinformatics. 2004 Jul 23;5(1):100(microarray で釣ってきたような)遺伝子群をアノテーションベースでグラフっぽくクラスタリングしてみたというお話．つまり，A,B,C とい…

Coexpression analysis of human genes across many microarray data setsGenome Res 2004 Jun;14(6):1085-94複数のデータソースから何か意味をひねり出そうというお話．具体的には複数のデータソースで発現パターンが相関している遺伝子は何らかの意味があ…

Genome-wide discovery of loci influencing chemotherapy cytotoxicityProc Natl Acad Sci U S A. 2004 Aug 10;101(32):11809-14薬剤感受性(毒性)に相関するゲノム上の位置を(ゲノムワイドに)探し出しましたってお話．対象としているのは 5-FU と docetaxel…

Gardener さん経由技術系サラリーマンより，初等幾何の問題．昔塾講師で教えた気がする．こいつは補助円を使うのがミソ．色んなところに同じ長さの線が(5本)できて，最後は円周角の定理でパシッと求まるのだ．懐かしい

Overweight, obesity and cancer: epidemiological evidence and proposed mechanismsNat Rev Cancer. 2004 Aug;4(8):579-91って記事が出てた．リスクファクターだってだけの話だけど，衝撃的なタイトルだ :-)

Fragment-based lead discoveryNat Rev Drug Discov. 2004 Aug;3(8):660-72今までのライブラリーベースでの HTS じゃぁ Hit が少ない or 開発がしにくいじゃんかってお話．いまのライブラリーは業界標準である Rule of 5を元にして作っているんだけど，この…

Drug repositioning: identifying and developing new uses for existing drugsNat Rev Drug Discov. 2004 Aug;3(8):673-83特許切れジェネリック医薬品の話ではなく，開発当初とは思っても見なかった別の作用での医薬品の話．サリドマイドの話が有名．このレ…

Statistical modeling for selecting housekeeper genesGenome Biol. 2004;5(8):R59.RT-PCR なんかでコントロールとして使う遺伝子に求められる性質は，モリモリ発現していて変動が少ないってこと．それを指標にして housekeeping gene として良いのはなんだ…

選手を壊して行くジーコは捨て捨てだと思ってるんだけど，グダグダながら勝っているのはドイツっぽいというか強豪っぽくなっているということなのかなぁ? ただし，僕の気持ちはアジアカップで優勝してもジーコはNo!なんだ．

Mixture models for assessing differential expression in complex tissues using microarray dataBioinformatics. 2004 Jul 22;20(11):1663-9Normal v.s. tumor の比較を(microarray で)行おうとするとき，LCM(laser capture microdissection) なんかを使…

コッリーナが最高 :-)

Second-generation biopharmaceuticalsEuropean Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics in press(広義の)タンパク製剤の現状に関するレビューだった．触れているのは，変異を加えたタンパク製剤・(ヒト化)抗体・fusion protein・PEG 化に代表される…