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Alternative mapping of probes to genes for Affymetrix chips
BMC Bioinformatics. 2004 Aug 14;5(1):111
NetAfx でついているアノテーションって言うか，probe ⇔ gene の対応関係ゲロゲロ，ウチでちゃんとしたの作ったよってお話．でも，イマイチどう作ったのか明確じゃないように感じた．基本線は
- RefSeq と各プローブ(25mer だかのやつ)の対応関係を blast
- RefSeq に当たらないやつは無視
- 機能の被らない複数の RefSeq に当たるヤツも無視
ってな感じで作ったようだ．成果ブツは著者らのサイトから手に入る．bioconductor でつかうのが前提かな?
# official annotation がゲロゲロだとは知らなかった……白々しいかな?
