Make-a-Flake - A snowflake maker by Lookandfeel new media

Chemical genetic control of protein levels: selective in vivo targeted degradationJ Am Chem Soc 2004 Mar 31;126(12):3748-54面白いアイディアと思った．基本は，ターゲットとなるタンパク特異的に結合する化合物と E3 uniquitin ligase 特異的に結合…

なんていうか，タイミング悪いなー．この悪運を W杯予選に生かして欲しい．

NHK でやってる火の鳥(黎明編)のアニメ版を嫁さんと見た．あの内容を全4回でやるのはツライなぁ．復活編は全2回ときたもんだ．ぶぅぶぅ言っていたら，嫁さんから一言コレを見て漫画を読もうと思う人が増えたらそれでいいじゃない負けました．あなたの言うと…

http://sportsnavi.yahoo.co.jp/soccer/japan/kaiken/200404/at00000413.html より今日は相手のシステム、１トップについての確認だった。ジーコからは特に指示はまだないです。格上との試合でも指示は無いのか……．予想通りだってのがまた悲しい．番狂わせな…

最高のインタビューだ．元川悦子 brava

Functional association between Wwox tumor suppressor protein and p73, a p53 homologProc Natl Acad Sci U S A 2004 Mar 30;101(13):4401-6WWOX と p73(p53 の typo に非ず．p53 homolog) との相互作用の話だった．WWOX の WW ドメインが p73 の 482PPPP…

柏村武昭議員の御発言この議員さんは偉大なる将軍様に全国民が従う姿が理想と思ってるんだろうなぁ．多様性が無いシステムは変革期には向かないぞ．

High frequency of mutations of the PIK3CA gene in human cancersScience 2004 Apr 23;304(5670):554タイトルのまんまだった．しかも 1ページ :-)．PI3K ファミリーを色んな癌サンプルでシーケンスしてみたら，PIK3CA だけに癌特異的変異が見つかり，しか…

「番狂わせ」なんてとんでもない を読んで思った．相手を分析して・作戦を練り実践する．必ずしも成功するわけじゃぁ無いとは思うけど，こういう姿勢が共感を呼ぶんだろうな．研究でも同じコトが言える気もする．それにしても五輪チームは見ていて清々しい気…

PLIER ってのがある．どうやら intensity が低いときに有利な normalization の様だ．真面目に聞いてみよう．ちなみに，Affycomp: A Benchmark for Affymetrix GeneChip Expression Measures に PLIER も登録されている

(被)影響遺伝子の同定 なるファイルを発見．t-検定だとマズイ場合があるよと言っていたんだけど，中々納得してもらえなかった．この文書を見せてから少し納得してもらえた．この文書に行き着いたキーワードは FDR(False Discovery Rate), Benjamini & Hochbe…

GENOMIC VARIANTS IN EXONS AND INTRONS: IDENTIFYING THE SPLICING SPOILERSNature Reviews Genetics 5, 389 -396 (2004)スプライシングに影響を与える変異に関するレビューだった(タイトルのまんま)．この辺のことを良く知らないので，とても参考になった…

SREBPs suppress IRS-2-mediated insulin signalling in the liverNat Cell Biol 2004 Apr;6(4):351-7まぁ，タイトルの通り．SREBP1 を過剰発現させると Insulin receptor substrate 2(IRS-2)を抑制することで insuling signaling を止めるって結論になって…

id:guide:20040420 さんより. これって， 自分が知りたい信じたい事を伝えないから信用しない に堕しがちだよね．

今夜 JSPORTS3 でやるんだけど，我慢できずに http://www.uefa.com を見に行っちゃった．

A functional protein chip for pathway optimization and in vitro metabolic engineeringScience 2004 Apr 16;304(5669):428-31こんな技術もあるんだぁ，知らなかったってのが第一印象．タンパクとその mRNA を共有結合的につないだ fusion molecule を作…

APPLIED BIOINFORMATICS FOR THE IDENTIFICATION OF REGULATORY ELEMENTSNature Reviews Genetics 5, 276-287 (2004)インフォマ系で転写因子関係をやりたいなら必読と思った．アルゴリズムから生物学的背景までよくまとまっていると感じた．ちょっと生物系は…

辺境から戯れ言経由．目・耳はこうやって塞がれていくのだろうか? 僕としては退避勧告なんておせっかいは止めて，捕まっても放置するから宣言だけにして欲しいと思う．情報ソースは複数あるのが健全なんだ．最近メディアの人民日報化，旧プラウダ化に危機感…

情報を集めるとき，意識的にせよ無意識的にせよ何らかの前提・仮説に基づいて情報を集めることになると思う．その結果，自分の前提・仮説にとってキモチイイ情報ばかりを集めてしまうことになりがちだ．自分の前提・仮説に都合の悪い情報を集めることは，辛…

日本版 LocusLink? H-Inv DB のことですね．ヒト FANTOM って感じっすね．

A gene atlas of the mouse and human protein-encoding transcriptomesProc Natl Acad Sci U S A 2004 Apr 9UCSC の 4月12日 Newsに出ていて気が付いた．以前に読んだ記事の続編だね．著者も組織も同じだし．計測対象が増えたのが目新しいところかな? Regio…

Unraveling gene-gene interactions regulated by ligands of the aryl hydrocarbon receptorEnviron Health Perspect 2004 Mar;112(4):403-12なんで，この雑誌に載ってるのか良く分からない :-)．要は 3値化(-1,0,1) した発現量をブーリアンネットワークっ…

Characterization of a common susceptibility locus for asthma-related traitsScience 2004 Apr 9;304(5668):300-4すごいっすね．実際の研究過程・時系列は別にして，家系解析していって喘息に関わる locus (chr7) を同定して，調べてみたら GPCR っぽいの…

Control of pancreas and liver gene expression by HNF transcription factorsScience 2004 Feb 27;303(5662):1378-81小粒でもピリリと辛い．そのスジでは有名なHNF(hepatocyte nuclear factor) が(肝・膵)で制御している遺伝子を ChIP を使って洗い出しま…

ガンダムファン偏りの系譜 僕はハト派ファースト原理主義かな?

デポルティーボキタ━━━━(゜∀゜)━━━━ッ!! 昨日に続き大番狂わせ．おもろい

A new, structurally nonredundant, diverse data set of protein-protein interfaces and its implicationsProtein Sci 2004 Apr;13(4):1043-5510年くらい前は好きだった構造系のお話．タンパク同士の接触面の分類を行ったというお話．全部で 103種類の接触…

明日，元指導教官の元へ喋りに行くことになってます．もうちょっと早ければ花見が出来たのだが……．

Metagenes and molecular pattern discovery using matrix factorizationProc Natl Acad Sci U S A 2004 Mar 23;101(12):4164-9タイトルだけではよく分からなかったけど，やっていることは maximize non-negativity decomposition (著者らは non-negative ma…