Coexpression analysis of human genes across many microarray data sets
Genome Res 2004 Jun;14(6):1085-94
複数のデータソースから何か意味をひねり出そうというお話.具体的には複数のデータソースで発現パターンが相関している遺伝子は何らかの意味があるだろうという仮説を検証してみたというお話.違う組織,例えば中枢神経系と肝臓で発現パターンが似ているということにどれほどの意味があるのか分からない.偶然 or 非常に基本的な機能が似ているってオチになりそうだと思った.最終的にはランダムと比べて GO Term association が大きいという有りがちな,でも重要な結論に至っていた.DNA replication/cell cycle や ribosome/translation などといった全ての細胞で共通する機能だけが釣れて来たってのは,このやり方では当然の帰結だと感じた