メツに決まりましたか．韓国との差が開きそうだな……．

A Family with Severe Insulin Resistance and Diabetes Due to a Mutation in AKT2Science 2004 May 28;304(5675):1325-8poly-genic ではなくて，monogenic に糖尿病に関わっている遺伝子として，AKT2(こいつ自体は前から AKT-signaling pathway で有名)を…

各所で話題になっている The R Book がウチにも届いた．パラパラと斜め読みしていたときに，最近ハマッたことに関わる部分があった．p. 372 なんだけど Calls ってのがある．通常はコレで問題なく動くし，bioconductor 1.3 以前でも動く(動いていた)んだけど…

(有機)水銀が一部の自閉症の原因ではないかと言われ，キレート剤が効くという話がある(http://www.kcn.ne.jp/~gauss/env/tb3.html)．また，この水銀源として三種混合ワクチン(MMR)の防腐剤として使われているチロメサール(thiromesal)が挙げられています．こ…

Gaussian mixture clustering and imputation of microarray dataBioinformatics 2004 Apr 12;20(6):917-23欠損値予測ものだった．アレイデータでの欠損値を PCA(っていうか SVD), k-NN 法を使った欠損値，そして彼らの使っている GMC(Gaussian mixture clus…

Pharmacogenetics in the treatment of breast cancerPharmacogenomics J 2004;4(3):143-53Tamoxifen, cyclophosphamide などを例に取りながら乳癌治療薬の効果と毒性に関連する SNP を関連する biology を説明しながら紹介する綺麗にまとまったレビューだと…

Mutational Analysis of the Tyrosine Phosphatome in Colorectal CancersScience, Vol 304, Issue 5674, 1164-1166 , 21 May 2004大腸癌サンプルをシーケンスしたら Tyrosine Phosphatase and kinases に変異が見つかったという話．変異が見つかったのは PT…

縦列駐車ゲームを発見 おフランス語サイト．結構難しいですね

と書いただけで，応募したことになるらしい :-) http://d.hatena.ne.jp/keyword/%a4%cf%a4%c6%a4%ca%cb%dc%cd%df%a4%b7%a4%a4%a1%aa 参照

Jan Oosting has contributed an Excel macro that will create exprSet objects from microarray data in Excel. ってのが The Bioconductor Project Excel Software に出ている．試してみようっと．

ここの社長様とは何度かお話をしたことがあります．キーパーソンの能力はあると思うのですが，全体としてみたときどうだろう? 最初に掴まされた品がグタグタ(納品チェックしたのかぁ?)だったのがトラウマになっています．最終的には及第点の取れるブツが帰っ…

Comparison of different isolation techniques prior gene expression profiling of blood derived cells: impact on physiological responses, on overall expression and the role of different cell typesPharmacogenomics J. 2004;4(3):193-207臨床検体…

Discovery and development of bevacizumab, an anti-VEGF antibody for treating cancerNat Rev Drug Discov. 2004 May;3(5):391-400この2月に FDA から認可を受けた bevacizumab(Avastin) を振り返るって話．こいつは，VEGF，要するに血管新生を司るタンパ…

日本人は検索が苦手?って記事がでていた(必要もないのに，Java が動くぞ．w3m 推奨). 要するに，日本では Google よりも yahoo が強いぞってコトらしい．

Bioconductor Ver 1.4 がリリースされました．ただし，R ver. 1.9.x が必要です．

Protein ranking: from local to global structure in the protein similarity networkProc Natl Acad Sci U S A 2004 Apr 27;101(17):6559-63イロイロな尺度で作った Protein Similarity Network を Google の pagerank みたいな尺度でランキングしましたっ…

http://www.cji.jp/Link/coffebreak/story25.htm にあった方々ですけど，王族ではあっても王女ではないのかもしれない．でも，本物っぽい．http://www.nettyroyal.nl/ などで調べてみたら 英国 Lady Gabriella Marina Alexandra Ophelia Windsor http://www.…

気になるポイント 複雑化したシステムを単純化しようという動きが無い 若い人に頼って，老齢人口を支えるってネズミ講システムじゃないの? どうやれば他人の年金納入状況を調べられるの? あたりかな．

Novel RNAs identified from an in-depth analysis of the transcriptome of human chromosomes 21 and 22Genome Res 2004 Mar;14(3):331-42Transcriptome Project とか，Affymetrix Experimentally Derived Transcriptome(UCSC Genome Browser)とかを見てい…

どうやったら，他人の年金加入状況が分かるのだろう? 社会保険庁な人達がリークするのかな?

Encoded self-assembling chemical librariesNat Biotechnol 2004 May;22(5):568-74化合物ごとに異なる DNA 配列を(共有結合的に)結合させたもので Binding assay を行うって話だった．どの化合物がターゲットとしている物と bind しているかは，array like …

各国王女わが君をネタに使うとは不敬な……．我らが王女だけ別格ですね(笑)

テーブルアート(HTMLタグ)のページGD モジュールを使うまでも無いような場合に良いかもね．

Orthologous gene-expression profiling in multi-species models: search for candidate genesGenome Biol 2004;5(5):R34『rat, mouse, human で似たような発現パターンを示す orthologous genes は，fundamental biological response に対応するである』っ…

An autonomous molecular computer for logical control of gene expressionNature 2004 Apr 28DNA コンピュータってよりは，Drug Delivery system って方がしっくりくるかなぁ? (任意の)遺伝子発現パターンに対して最適なアンチセンス配列を放出する仕掛け…

Ogishima Diary より，The Glenn Gould Archive なるものを発見．太っ腹だなぁ．実はグールドのファンなのだ．初めて聞いたときは『鼻歌』が気になってしょうがなくなったのだが，今は気にならなくなった :-)

1990 年代で一番面白かった(強烈だった)と思うのは，国民クイズ(ISBN:4063283658) だなぁ．クイズに優勝すれば，双子の処女と3Pしたいとか，全国民骨髄バンク登録強制とかのどんな希望も国民クイズ省及び賞罰執行隊(SS隊)が叶えるというハチャメチャな設定．…

抗がん剤イレッサ、効き目は遺伝子の変異で差 日米調査ってのがサイエンスに載る(Science Express 29/Apr/2004 のトコロ)って話が出てる．ほぼ同じ内容と思われる論文がNew England Journal of Medicine の Early Issue にも出ている．To coincide with the …