日本代表が好きなのに……何故，素直に喜べないのだろうか? ドイツ的しぶとさが身に付いて来て強くなっていると思えばよいのだろうか?

引き分けてこの結果がベストかなぁ?シンガポール戦の結果は？

CHEMOGENOMICS: AN EMERGING STRATEGY FOR RAPID TARGET AND DRUG DISCOVERYNature Reviews Genetics 5, 262 -275 (2004)なんで pubmed で引っ掛からないんだろう? とりあえず読んでみたけど概念的に新鮮なものは無かった．でも参考文献が豊富なのでレファレ…

ロベルト・カルロスのフリーキックすごすぎ．

昨日のウィルスは Netsky.Q の様でした．これまで，どんなウィルスも受け取ったことが無く寂しい思いをしていた*1のですが，コレで初めて人並みになれた気がします． *1:Port135/445 を叩く奴は一杯来るんだけどね．Nachi 系は少なくなった

The operons, a criterion to compare the reliability of transcriptome analysis tools: ICA is more reliable than ANOVA, PLS and PCAComput Biol Chem 2004 Feb;28(1):3-10なんと言いますか……ICA マンセーなお話でした．PCA/ICA に共通する仮定として …

誰かウィルスに感染していないかな? (詐称されている) From 行が某ML の方面特有のモノが多い．WWW ブラウズのログからかもしれないけど……

A functional genomic study on NCI's anticancer drug screenPharmacogenomics J 2004;4(2):127-35NCI60 をどう使っているのかっていう一例……なんだけど，イマイチ．一見すると相関していないように見えるペアに，第三のパラメータ(例えば，別の遺伝子)を考…

神聖ジーコ帝国 なるページを発見．キッツイなぁ カリ城風スパ．んまそー

From silencing to gene expression: real-time analysis in single cellsCell 2004 Mar 5;116(5):683-98副題と言うか，ページヘッダには "Visualizing Gene Expression in Living Cells" とある．読み応えがあって，中々読み進まない(涙)．DNA, RNA のそれ…

Gene expression profiling identifies clinically relevant subtypes of prostate cancerProc Natl Acad Sci U S A2004 Jan 20;101(3):811-6見落としていました．発現パターンでクラスタリングしてみたら，前立腺癌を腫瘍部分と正常部分を判別しただけでな…

EXPRESSION PROJECT FOR ONCOLOGY (expO) ってのを発見．

Optimization models for cancer classification: extracting gene interaction information from microarray expression dataBioinformatics 2004 Mar 22;20(5):644-52multi-class SVM なお話…筆者らはイロイロと違いを述べているけどね．例によって，Golub…

Extracting human protein interactions from MEDLINE using a full-sentence parserBioinformatics 2004 20(5):604-611MEDLINE abstract からの情報抽出 by MedScanな話．構文解析を真面目にやった後に(自作)オントロジーに解析結果を載せている．オントロ…

五輪出場バンザーイ．喜びを踊りで表現していたら嫁さんに馬鹿にされました:-)

Quantifying the relationship between co-expression, co-regulation and gene functionBMC Bioinformatics 2004, 5:18発現量が相関している遺伝子は共通の Transcription Factor Binding Motif/site を上流に持つか? ってのを調べたお話．Yeast をネタにし…

R統計システムについてのよくある質問

A census of human cancer genesNat Rev Cancer 2004 Mar;4(3):177-83COSMIC のところがやったお仕事．まぁ，関連する仕事なんだろう．やることは両者ともほぼ同じだからね．彼らは，2報以上の報告がある癌患者からのサンプルから変異が見つかった遺伝子を漁…

勝ちぬけのルールが良く分からないので不安だ．勝ち点が同じ場合は，得失点差が優先なのだろうか? それとも，直接対決の成績が優先なのだろうか……?

Biological graph layout and display

Overexpression of c-maf is a frequent oncogenic event in multiple myeloma that promotes proliferation and pathological interactions with bone marrow stromaCancer Cell 2004 Feb;5(2):191-9oncogene として知られている c-maf (MAF_HUMAN@UniProt)…

んー，負けちゃいました．次はがんばれ．でも，ヤケ酒飲んじゃいました．

VX-680, a potent and selective small-molecule inhibitor of the Aurora kinases, suppresses tumor growth in vivoNat Med 2004 Mar;10(3):262-7非生物・合成でもない人に知られている VX-680のお目見え論文．Aurora Kinase specific inhibitor を開発し…

英国のヨークから友人が 5年ぶりに帰日した．彼曰く， 恋と革命と研究が人生の３大テーマ らしいのだが，最後以外はうまく行っていないらしい．保守化しているるんだと，自己批判し総括していた :-)．相変わらず某ML*1 主催者と同じくらいパワフルな奴だ．エ…

Gene Expression Signature of Fibroblast Serum Response Predicts Human Cancer Progression: Similarities between Tumors and WoundsPLoS Biol 2004 Jan 13;2(2)PLoS にチェックを入れとくのを忘れていた．Alertとアンテナに登録．癌の浸潤と傷が治る過…

Unbiased Mapping of Transcription Factor Binding Sites along Human Chromosomes 21 and 22 Points to Widespread Regulation of Noncoding RNAsCell 2004 Feb 20;116(4):499-509 Affymetrix な方による，Transcription Factor Binding sites (TFBS) って…

Structural Determinants of Allosteric Ligand Activation in RXR HeterodimersCell, Vol 116, 417-429, 6 February 2004面白くて，まだ読みきれてない．完全にメモ状態だな．multiple alignment を取って，各ポジション毎のアミノ酸頻度を求めて，共変化(…

田中達也 フロド で検索する人がいるようなのでサービス． コレが田中達也で(from 浦和レッズのページ) コレがフロド・バギンズです.(画像削除)

僕の気持ちは ichan 様に近い．ただ，反対というか微妙に異なる文書も発見．専門家は個人の責任で情報発信するなこういう意見があることも知った上で，自分のスタンスを確立せねば……．とりあえず，header を変えるかな

Read before you cite!slashdot 本家 やNew scientist の紹介記事参照冗談なのか真面目に書いてるのか判断つかないんだけど，結論が面白かった． Our estimate is only about 20% of citers read the original. 著者らは References におけるミススペルに着…