Global Identification of Human Transcribed Sequences with Genome Tiling ArraysScience. 2004 Dec 24;306(5705):2242-2246Affymetrix では無いところから出た，ヒト全ゲノムタイリングアレイな話．maskless photolithographic DNA synthesis technology …

Thunderbird 日本語版が出た．嫁に使わせてみようかな :-)

デッドライン―ソフト開発を成功に導く101の法則を購入してみた．これはソフト開発の話というより一般的なプロジェクト管理の話だと思った．頷けるところ大なので，同じ著者の別の本 ゆとりの法則 ? 誰も書かなかったプロジェクト管理の誤解 も購入することに…

NAR Database Issue 2005 出てる♥

Integration with the human genome of peptide sequences obtained by high-throughput mass spectrometryGenome Biology 2004, 6:R9坊氏も目を留めた一報．Mass で同定した全てのペプチドをゲノム上にマップしたぞって話．EST じゃなくて EPT って感じかな…

毛筆崩し書体生成システムなんてのを発見．年賀状に使えるかな? ougishi って王羲之のことだな．

biobarなる拡張を発見

Pfizer Finds Celebrex Heart Attack RiskCOX-2 阻害剤の癌適応に関する臨床試験で心疾患イベントがプラセボに比して 2倍高くなったということで臨床治験を中止したようですね．回収はまだ考えていない模様．VIOXX に引き続きということで，COX-2 回りには激…

Effects of pooling mRNA in microarray class comparisonsBioinformatics 2004 Dec 12;20(18):3318-25(コストカットのために)サンプルをプールして測定すべきか，プールしないで測定すべきかを検討した話．要は，検出力を保ちながらアレイの数を減らす為に…

Time-related differences in the physical property profiles of oral drugsJ Med Chem. 2004 Dec 2;47(25):6338-48Something never change (Nature Reviews Drug Discovery 4, (2005); doi:10.1038/nrd1614)に出ていた興味深い記事の元ネタ．最近数十年に…

警察の電話偽装表示 ってコトなので，ナンバーディスプレイは信用ならんと言うことか……．セチガライ世の中になってきたのぉ

Poll: Math applicationsなんてコトをやっている．統計ソフトに何使ってるってアンケートで，Rが一位になっている．同記事にかかれているように，S/S-Plus を使う人より R を使う人が多いのに，Matlab を使う人の方が (Matlab のオープンソース版である) oct…

Noise filtering and nonparametric analysis of microarray data underscores discriminating markers of oral, prostate, lung, ovarian and breast cancerBMC Bioinformatics. 2004 Nov 29;5(1):185(シグナル値依存的な)ノイズの大きさを見積もって fold-…

某所でのお喋りのために，パッケージの導入法を再確認．以前にはまった YEAST *1 は library(reposTools) z http://www.bioconductor.org/data/metaData") install.packages2("YEAST", repEntry=z) とやれば良いことに気づいた．ただし，このやり方で golubE…

A probabilistic functional network of yeast genesScience 2004 Nov 26;306(5701):1555-8何故サイエンスに載るのか良く理解できなかった X-(．様々なデータソースとパスウェイデータベースを(Bayes like に)つき合わせて信頼度の高いネットワークを作りま…

Computational and Statistical Aspects of Microarray Analysis

大学院進学はまちがいなく自殺行為である安易に大学院進学させるのはまちがいなく殺人行為である

Prediction of survival in follicular lymphoma based on molecular features of tumor-infiltrating immune cellsN Engl J Med 2004 Nov 18;351(21):2159-69.濾胞性リンパ腫の生存(年数)を予測するマーカを遺伝子プロファイルより得てみたらビックリってお…