某所でのお喋りのために，パッケージの導入法を再確認．以前にはまった YEAST *1 は library(reposTools) z http://www.bioconductor.org/data/metaData") install.packages2("YEAST", repEntry=z) とやれば良いことに気づいた．ただし，このやり方で golubE…

bioconductor for Windows 版 R へYEAST Metadata を放り込むのにはまった．何のエラーも無くインストールできたんだけど， library(YEAST) Loading required package: YEAST Error in namespaceExport(ns, exports) : undefined exports: YEASTENZYME, YEAS…

1.5 出た♥ R-2.0 仕様なのが何とも……

Bioconductor ver. 1.5 がリリースされるはずなのだが……

To Pool or Not to Pool: A Question of Microarray Experimental Design なる文書を bioconductor ML より入手した．結論は「サンプル数が 3以下なら，プーリングした方が良い」だった．関連論文もいくつかあるようなので，チェックしておこう

library(hgu95av2) library(GO) get("GO:0016787", env=hgu95av2GO2ALLPROBES) get("GO:0016787", env=hgu95av2GO2PROBE)

各所で話題になっている The R Book がウチにも届いた．パラパラと斜め読みしていたときに，最近ハマッたことに関わる部分があった．p. 372 なんだけど Calls ってのがある．通常はコレで問題なく動くし，bioconductor 1.3 以前でも動く(動いていた)んだけど…