Biologically valid linear factor models of gene expression
Bioinformatics 2004 Nov 22;20(17):3021-3033
発現パターンを線形分解して,どんな確率分布が妥当かってのを検討したって話.単なる PCA(ガウス分布) はマズーってことのよう.一様分布 or ラプラス分布が妥当っぽいって話で,これは ICA による解析で GO category enrichment が激しいってのと対応すると感じた.僕は確率分布を仮定するこの論文のやり方より,NMF や ICA の方が好きだな