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Evaluation of gene expression measurements from commercial microarray platforms
Nucleic Acids Res. 2003 Oct 1;31(19):5676-84
ちょっと前のサイエンスでも触れられていた去年の論文．要は Affymetrix, Amersham (一色), agilent(二色)の異なる platform で同じサンプルを測定したら，結果がイマイチ揃わなかったという話．具体的には分化誘導前後で有意に変化する遺伝子のリストを作成して(ベン図を書いて)みたら，共通して引っ掛かってくるのが予想外に少ない(40% at max)という報．データの取り扱いって難しいですね