PerlMolでハマッた.どうやら "M CHG" 行が無いと電荷の認識をしないようだ.プログラムのしやすさという意味では perlmol が良いのだが,全体的な機能という意味ではThe Chemistry Development Kit (CDK)の方が良い感じ.でも機能が多すぎて全体を見渡せな…
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