Correlating gene expression with chemical scaffolds of cytotoxic agents: ellipticines as substrates and inhibitors of MDR1.
Pharmacogenomics J. 2005 Jan 25
結構面白かった.化合物 7466個の NCI-60s に対する GI50(Growth Inhibition) と microarray(756 遺伝子) の結果 GI50 と順・逆相関する遺伝子・化合物ペアを抜き出してきて興味深い化合物群(ellipticine 類似化合物群)に関して考察を進めている.この化合物は MDR1(薬物排出系)のシグナル値と GI50 が順相関するものから無相関・逆相関までいろいろあって興味深い.化合物を抜き出してきてからは比較的 conventional な解析だった.とにかく力技なのに脱帽