Single cell profiling of potentiated phospho-protein networks in cancer cells
Cell 2004 Jul 23;118(2):217-28
Cancer cells と書いてるけど調べてるのは白血病だけ.STAT 1/3/5/6, p38, Erk1/2 のリン酸化状態が刺激(FL, GM-CSF, G-CSF, IL-3, IFNγ) によってどう変わるかを様々な donor から取ってきたサンプルに対して調べてクラスタリングしてみたってお話.こういうのは microarray では出来ないね.この結果が綺麗に薬効と対応していたりしていてとても興味深い.以前に聞いたセミナーでも transcripts/タンパク の量よりもリン酸化されたタンパクの量の方が薬効予測には有効といった話が出ていたので,それとも対応すると思った.こういったリン酸化状態を comprehensive に調べるって戦略に最近興味を持っている.なんと言っても直接的かつ分かりやすいからね.