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caCORE: a common infrastructure for cancer informatics
Bioinformatics 2003 Dec 12;19(18):2404-12
うーん,見落としていた.cancer 関係のオントロジーを整備して,データ・アプリケーション企画を定め,SDK も作りましたっていうお話.一つ一つの技術は IT 的には大した事では無いのだろうけど,ちゃんと作り上げたというのは素晴らしい.インフォマティクスとしては重要でないかも知れないけど,バイオインフォマティクスとしては重要である一つのパターンだと思う.
これが参照しているデータ(ソース)としては,
- Unigene, LocusLink, Homologene
- CGAP, NCI60
- CMAP
- GoldenPath
- BioCarta
- NCI Metathesaurus, NCI Thesaurus, CMAP Ontology, GO
- Cancer Data Standards Repository
なんかが挙げられている.こういったデータを一度に扱うアプリケーションが今後でてくるのかな? ちょっと楽しみ.